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UK Biobank construirá una plataforma de análisis de datos alojada en AWS con DNAnexus para acelerar la investigación

UK Biobank ha obtenido fondos para construir una plataforma de análisis de datos en la nube de Amazon Web Services (AWS) que espera facilitará a los investigadores de todo el mundo el acceso a los datos de salud que contiene.

En funcionamiento desde 2006, Biobanco del Reino Unido es un estudio a largo plazo centrado en establecer cómo la genética y los factores ambientales contribuyen a la aparición de enfermedades humanas, y sus conocimientos se basan en datos de salud recopilados de más de 500.000 voluntarios del Reino Unido.

Durante los próximos cinco años, el proyecto estima que la cantidad de datos almacenados en su base de datos aumentará a 15 PB, lo que probablemente dificultará el acceso a la información para los investigadores que dependen de ella.

“Los datos se proporcionan actualmente a investigadores aprobados para su descarga, lo que requiere una cantidad sustancial de espacio de almacenamiento local costoso, así como potencia de cálculo”, dijo UK Biobank en un comunicado.

Esto, a su vez, limita el rango de investigadores que pueden usar la información a aquellos que tienen la capacidad de almacenar y procesar grandes cantidades de datos localmente, razón por la cual se está desarrollando una alternativa basada en la nube.

Rory Collins, investigador principal de UK Biobank, dijo que el éxito de toda la iniciativa reside en la capacidad de hacer que los datos que posee la organización sean accesibles a la mayor variedad posible de equipos de investigación.

“Esta nueva plataforma democratizará el acceso, ayudándonos a dar rienda suelta a la imaginación de las mejores mentes científicas del mundo, dondequiera que estén, para hacer descubrimientos que mejoren la salud humana”, dijo.

La financiación para el proyecto es proporcionada por la organización benéfica de investigación enfocada en productos farmacéuticos Wellcome, mientras que la plataforma en sí se está desarrollando a través de una colaboración entre AWS y el proveedor de plataforma de gestión y análisis de datos con sede en EE. DNAnexus.

Además de proporcionar la parte de alojamiento y computación del proyecto, AWS también se ha comprometido a proporcionar 1,5 millones de dólares en créditos de investigación a investigadores de carrera inicial aprobados y a aquellos que viven en países de ingresos bajos y medios, para ampliar la gama de contribuyentes al Reino Unido. Biobanco.

Una vez que la plataforma esté completa, estos investigadores podrán analizar los datos que necesitan dentro de la plataforma alojada en la nube, que según UK Biobank abrirá el acceso a ella, pero también hará que su procesamiento sea más rápido y más rentable.

“La plataforma de UK Biobank no solo hará que los datos sean más accesibles para más investigadores en principio, sino que también, como consecuencia de la extraordinaria generosidad de AWS, será más accesible en la práctica”, dijo el Dr. Mark Effingham, director ejecutivo adjunto de UK Biobank. .

“La informática gratuita para los investigadores que trabajan en entornos de escasos recursos y para los científicos jóvenes que comienzan una carrera en la investigación es una forma fantástica de aumentar el uso del increíble recurso de UK Biobank”.

En el momento de escribir este artículo, se espera que la plataforma esté activa y lista para que los investigadores la utilicen en el verano de 2021, y su desarrollo y pruebas se llevarán a cabo durante 2020 y durante la primera mitad del próximo año.

Richard Daly, director ejecutivo de DNAnexus, dijo que su trabajo con UK Biobank es el último de una larga lista de proyectos de investigación que su tecnología se ha utilizado para respaldar en los últimos años.

“Durante los últimos 11 años, DNAnexus ha apoyado los diversos objetivos científicos de los investigadores de todo el mundo, acelerando la transformación digital al simplificar el análisis de datos complejos, la gestión de datos clínicos y los conocimientos a escala”, dijo Daly.

“Apoyamos con entusiasmo el proyecto fundacional del Biobanco del Reino Unido, ya que abre nuevos caminos en el avance de la investigación de enfermedades a través de la integración de datos de salud profundos con genómica y herramientas avanzadas “.

Pilar Benegas
Pilar Benegas es una reconocida periodista con amplia experiencia en importantes medios de USA, como LaOpinion, Miami News, The Washington Post, entre otros. Es editora en jefe de Es de Latino desde 2019.

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