A su regreso a Toronto, el Sr. Schafer en 1962 cofundó la innovadora serie de conciertos Ten Centuries, que presentaba música nueva y rara vez escuchada.
A medida que su carrera se recuperaba, respondió a las solicitudes de nuevas obras con irreverencia, componiendo «Son of Heldenleben», un riff paródico del poema tonal de Richard Strauss, y «No Longer Than Ten (10) Minutes», en la que una orquesta entona arriba, un director entra y sale del escenario, y los jugadores aumentan cada vez que el público intenta aplaudir. Su «Requiems for the Party-Girl» de 1966, escrito para la mezzosoprano Phyllis Mailing, es un monodrama virtuoso y oscuro en el que una mujer canta sobre su inminente suicidio.
El Sr. Schafer se casó con la Sra. Mailing en 1960 y se divorciaron en 1971. Su segundo matrimonio, con Jean Reed, desde 1975 hasta aproximadamente 1999, también terminó en divorcio. Se casó con la Sra. James en 2011 después de una larga relación. Junto con ella, le sobrevive su hermano Paul.
El Sr. Schafer comenzó su investigación sobre paisajes sonoros después de unirse a la facultad de la Universidad Simon Fraser en 1965. También inventó un enfoque radical de la enseñanza, llamándolo «educación musical creativa». En una serie de folletos influyentes, proporcionó ejercicios para fomentar la creatividad de los niños, pidiéndoles que «traigan un sonido interesante a la escuela» o tarareen junto con una melodía que habían escuchado en una esquina.
Junto al teatro mítico de «Patria», el Sr. Schafer compuso partituras más convencionales, entre ellas 13 cuartetos de cuerda y «Letters from Mignon», una canción neorromántica que contiene cartas de amor que le escribió la Sra. James. Su oratorio de género “Apocalypsis” se interpretó por primera vez con un elenco de más de 500 personas en 1980; recibió un renacimiento triunfal y que coronó su carrera en el Festival Luminato en Toronto en 2015.
En un cortometraje de 2009 dirigido por David New, el Sr. Schafer ofrece reflexiones filosóficas sobre cómo escuchar en medio del paisaje sonoro nevado fuera de su casa, una granja remota en el área de Indian River en el sur de Ontario.